包皮上有小疙瘩，应当先明确小疙瘩的性质，然后再进行针对性的治疗。如果包皮上的小疙瘩是脂肪粒，一般没有任何临床症状，不需要进行特殊的处理，也不会对生殖系统造成影响。如果包皮上的小疙瘩是尖锐湿疣，可能还伴有瘙痒、疼痛等症状，应当进行抗病毒治疗，并且通过激光疗法进行去除，在治疗期间应禁止性生活。如果是包皮龟头炎所导致的包皮上小疙瘩，在确诊以后应当使用一些外用药物进行治疗，比如红霉素软膏、克霉唑软膏。