治疗肠炎时，如果腹泻，可以口服蒙脱石散收敛止泻，口服双岐杆菌四联活菌片或酪酸梭杆菌片等益生菌调理肠道菌群。使用复方谷胺酰胺片保护肠黏膜，减轻肠道炎症，有腹痛时酌情使用颠茄片或者复方匹维溴铵片等药物调理，尽早完善大便常规、大便培养检查，如果考虑细菌性肠炎可使用头孢类或喹诺酮类抗生素抗菌治疗。因真菌导致的肠炎需要使用氟康唑治疗，所有肠炎患者均需要饮食清淡，容易消化，避免进食辛辣刺激食物，不宜吸烟饮酒以及喝碳酸饮料，注意腹部保暖，规律作息，规律就餐。