大黄蛰虫丸临床有一过性的过敏反应。患者皮肤出现潮红、发痒，停药后即消失。初服的时候有的病例有轻微的腹泻作用，一周后也能消失。有出血倾向者有可能加重出血或者鼻衄。大黄蛰虫丸具有活血、破瘀、通经、消癥瘕的功效。用于瘀血内停所致的癥瘕。用于盆腔包块、子宫内膜异位症、继发性的不孕症，慢性活动性肝炎、肝硬化、静脉曲张并发症与后遗症。症见腹部肿块、肌肤甲错、面色暗黑、潮热、羸瘦、经闭不行等。