十二指肠炎应用的药物治疗，主要是质子泵抑制剂，比如常用的有奥美拉唑，兰索拉唑，潘托拉唑，雷贝拉唑等，具有强大的抑制胃酸分泌的作用，从而能够缓解症状，促进身体的恢复。另外，也可以选用h2受体拮抗剂，比如西米替丁，雷尼替丁，法莫替丁等，这类药物也具有抑制胃酸分泌的作用。另外，还可以选择胃粘膜保护剂，比如铝碳酸镁，硫糖铝或者胶体铋等，能够阻止胃酸和胃蛋白酶对粘膜的损伤，从而起到保护粘膜的作用，而且胶体铋，还能够杀灭幽门螺杆菌。另外也可以配合促胃肠动力药，比如莫沙必利等缓解症状。