科莫多巨蜥的天敌包括其他大型掠食动物，如鳄鱼、鳄鱼蜥、大型蛇类和鸟类。在其栖息地中，科莫多巨蜥也可能会遭遇其他食肉动物，如豹、豹猫和野狗等。此外，人类的活动也对科莫多巨蜥的生存构成威胁，如狩猎、森林砍伐和生态环境破坏等。