男性备孕检查可以去以下科室进行检查，如男科、泌尿外科、生殖科，对于备孕常规检查项目都可以进行，如精子质量、传染病检查、男性泌尿生殖系统检查以及体格检查等。男性在就诊之前，需要清洁外阴，禁欲二到五天；并且在空腹状态下看医生，避免对检查结果造成影响。