脑蛋白水解物主要是用于治疗颅脑外伤、脑血管病后遗症，伴有记忆减退及注意力集中障障碍症状的改善。不良反应主要包括注射过快会有轻度热感，少数病例会出现寒战、轻度发热以及过敏的反应，有些病人会造成肾功能不全，诱发或加重癫痫发作等。因此，脑蛋白水解物的禁忌证是包括癫痫病人、严重肾功能不全的病人、孕妇哺乳期妇女禁用，还有对脑蛋白水解物过敏的病人禁用。脑蛋白水解物不能与氨基酸注射液在同一瓶中进行输入，因为可以导致氨基酸不平衡。另外，与抗抑郁药同时应用可能会引起病人精神紧张，因此建议减少抗抑郁药的用量。