甲硝唑主要适用于治疗或者预防厌氧菌引起的感染。甲硝唑有一定的副反应，最常见的副反应是消化道的症状，包括恶心，呕吐，食欲不振，腹部绞痛，但是一般不影响治疗。还有神经系统的症状，有头痛，眩晕，偶尔会有感觉异常，肢体麻木，共济失调等，大剂量的可以导致抽搐。少数的病例会发生荨麻疹，皮肤潮红瘙痒，膀胱炎，排尿困难，口中金属味和白细胞减少等，均属于可逆性的，一般停药后可以自行的恢复。