没有症状的肝胆管结石可以不用治疗，仅定期观察随访即可。临床症状反复发作的患者应当行手术治疗，手术治疗的原则是尽可能的取净结石，解除胆道狭窄以及梗阻，去除结石部位和感染的病灶，恢复和建立通畅的胆汁引流，防止结石的复发。手术的方法主要包括：第一、胆管切开取石，这是最基本的方法，应该争取切开狭窄的部位，沿胆总管向上切开甚至可以达到二级胆管，直到取净结石。第二、就是可以行胆肠吻合术，用来不能作为替代对胆管狭窄，结石病灶的处理方法。第三、就是肝切除手术，肝内胆管结石反复并发感染，可引起局部的肝萎缩纤维化和功能丧失，切除病变的部分肝。第四、是术中的辅助措施，利用一些胆道造影，超声检查以确定结石的数量和部位，胆道镜还可以行术中取石，也可用碎石器械行术中的碎石治疗。第五、对于残留结石处理，由于肝内胆管结石手术后残留是非常常见的，约有20%以上，因此治疗措施还包括术后经引流窦道胆道镜取石，激光超声微波碎石，经引流管溶石、体外碎石以及中西医结合治疗等等。