肛周脓肿的治疗方法主要是手术治疗，只要脓肿液化比较好、触痛比较明显，就应该及时的进行手术治疗。手术切开引流，充分的把脓腔的脓液引流出来，这是第一点。第二点就是如果有条件时找内口，如果内口比较明显时要在这个内口进行挂线治疗，就是肛周脓肿根治性手术，降低了以后再发生肛瘘的概率。具体能不能做肛周脓肿根治性手术要根据术中的情况看，有些肛周脓肿内口比较明显，好找。有些肛周脓肿内口不容易找，不好找时以手术切开引流为主，术后要辅助以抗感染的药物治疗、抗生素的治疗，常见的就是头孢类抗生素加抗厌氧菌的奥硝唑或者甲硝唑持续治疗，术后还要加强换药。