肛瘘不治疗越拖延就会有越复杂的倾向，瘘管会延长增多，如果牵扯肛门括约肌比较多，术后还有可能对肛门功能造成极大的影响，并且复发概率也大大增加，有可能需要做很多次的手术。肛瘘反复破溃流出的黏性分泌物可能会导致肛管皮肤和直肠癌变，此外这个不定时的炸弹因为再次感染而爆发加重，为根治性手术带来困难，一旦拖延形成坏死性筋膜炎、肛周蜂窝组织炎，很有可能会危及生命，因此建议尽早去医院做手术治疗。