临床上胃食管反流炎，通常一般是考虑胃酸反流或者是胆汁反流所造成的食管炎症性的改变。也有一些病人考虑是内镜阴性的胃食管反流病。临床上一般采用质子泵抑制剂如奥美拉唑或者是雷贝拉唑口服治疗。同时加用一些保护胃黏膜的以及中和胆汁的药物如铝镁加悬液或者是磷酸铝凝胶。对于一些病人反流症状比较明显伴有反胃，恶心干呕，胃胀嗳气的病人，可以使用促胃动力的药物进行对症处理。对于一般的糜烂性食管炎通常疗程需要6到8周的治疗。