患儿在下丘脑垂体睾丸轴未稳定化的一岁以前应用丙酸睾酮治疗，每月一次肌注25毫克，连续治疗三个月，若过了这个时期可在七岁左右，促黄体激素释放激素开始夜间脉冲分泌时，间歇补充激素。如因阴茎本身雄激素受体缺失，对雄激素不敏感导致，雄激素治疗无效，常伴有尿道畸形。阴茎极度细短者应考虑改变抚养性别，在新生儿期或婴儿期进行女性外阴成形术，这种阴茎极度短细患者企图保留男性性别手术延长阴茎，不可能是阴茎达到正常大小及功能达到正常。间歇激素疗法，一年内两到三个疗程，通常在春夏治疗，每隔三到四周一个疗程。