肠胃不好引起口臭时，可以使用以下药物进行治疗：第一，胃肠动力药。特别是因为胃肠蠕动缓慢造成食物残渣长时间在胃肠道内潴留，容易引起口臭。此时可以使用多潘立酮片、莫沙必利片等药物进行治疗，促进胃肠平滑肌的蠕动，能够促进消化吸收，减轻口臭的症状。第二，使用消化酶制剂，如多酶片、胃蛋白酶等药物，可以促进消化吸收，减轻胃肠道负担，也能够减轻口臭的症状。第三，可以使用一些中成类药物，健胃消食，促进脾胃运化，也能够减轻口臭症状，如香砂养胃丸、健脾颗粒、健胃消食片等。