阴茎上面有个疙瘩最常见以下原因：1、珍珠状阴茎丘疹。主要是阴茎的冠状沟边缘，以及阴茎的上面会有小疙瘩，而且发红。2、包皮龟头炎症。主要是因为多种因素导致的龟头粘膜出现了损伤，会表现出小疙瘩、溃烂红斑的现象。3、尖锐湿疣。主要是感染了人乳头瘤病毒导致的，最典型的症状就是上面有小疙瘩，单个或者是多个呈现。根据以上情况的分析，如果是珍珠疹，可以选择不治疗，也可以选择激光去除；如果是包皮龟头炎症，可以通过包皮环切手术治疗；尖锐湿疣可以选择三氯醋酸或者冷冻的方式去掉。