副鼻窦炎的原因多为鼻部炎症、鼻部结构异常、全身因素。急性鼻炎反复发作容易引起急性副鼻窦炎。过敏性鼻炎、慢性鼻炎病程较长容易引起鼻窦病变，导致慢性副鼻窦炎。鼻部结构异常如鼻中隔偏曲、中鼻甲肥大、泡状中鼻甲、钩突肥大、鼻窦发育异常等影响鼻窦引流的因素都会诱发副鼻窦炎。鼻部肿物如鼻息肉、鼻腔乳头状瘤或鼻腔占位性病变也会并发副鼻窦炎。长期使用抗生素、糖皮质激素、免疫抑制剂药物或长期放疗的病人及有慢性消耗性疾病如糖尿病，免疫力低下时容易引起真菌性副鼻窦炎。