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脑癌的病因尚不清楚,伴发于斑痣性错构瘤病的颅内肿瘤与遗传有关,遗传因素很可能也参与一般脑癌的发病。胶质瘤常有染色体上等位基因的丧失。近年发现胶质瘤是由于19q上一个肿瘤抑制基因的缺失,多形性胶质母细胞瘤可能是染色体10和/或17上某个基因突变后发生的单克隆肿瘤。个别脑膜瘤、胶质瘤的发病可能由局部受损引起。在胚胎发育过程中,有些细胞或组织可停止生长而残留于颅内,以后可发展而形成脑瘤,称为先天性脑瘤,只占颅内肿瘤的一小部分。