急性肠胃炎的常见病因有细菌、病毒、寄生虫等病原体引起的感染性腹泻之外，还有可以由化学药物，饮食不当所导致的非感染性腹泻。最常见的细菌感染性腹泻对于中重度的腹泻患者来说，抗生素能将腹泻总时长缩短约一天半，喹诺酮类比如环丙沙星，左氧氟沙星是首选药，单剂量治疗或者治疗多达三天，通常足以治愈疾病。在抗生素治疗的前提下，如果水样泻症状仍然明显，可以考虑口服蒙脱石散，严重者口服洛哌丁胺。口服补液盐可以用于补充液体的丢失，必要时可以静脉补液。