过敏性结膜炎的最佳治疗方法就是查找过敏原，并且避免再次接触，平时可以辅助眼部冷敷。局部可以点抗炎类眼药水，包括：糖皮质激素滴眼液，如氟米龙眼药水，也可以用非甾体抗炎药，如双氯芬酸钠眼药水。同时辅助肥大细胞稳定剂或者抗组胺眼药水，如帕坦洛，埃美丁眼药水等进行治疗。但需要警惕长期使用激素可引起青光眼，白内障等并发症，这时可以选用免疫制剂来治疗（环孢霉素A或FK506眼药水）。严重者可以全身应用抗过敏的药物，如扑尔敏、西斯敏，以及氯雷他定等。