肝囊肿如果经常有轻微疼痛，常见处理方法如下：1、判断疼痛与肝囊肿的关系：先判定轻微疼痛与肝囊肿是否有相关关系。一般来说绝大部分的肝囊肿，基本上都很少引起症状，除非是肝囊肿生长比较大，或者肝囊肿内部出现张力增加、出血、感染、胆瘘等异常情况，或者肝囊肿比较大，引起了肝脏包膜的张力增加。这种情况下，才有可能会引起相关的异常症状，而如果没有这些情况，肝囊肿也比较小，出现了轻微疼痛，首先要排除一下是否为其他原因导致的轻微疼痛，而与肝囊肿本身没有相关关系；2、其他处理方法：要判定一下，如果确实是肝囊肿引起的相关症状。如肝囊肿比较大或者肝囊肿内部有相关的异常，一般建议考虑手术治疗。因为相对来说引起症状的肝囊肿比较麻烦，需要及时进行控制。当囊肿比较大或者囊肿内部出血、感染、胆瘘的情况下，需要及时进行手术，开创引流才能够达到比较好的治疗效果。