如果发现肛门里面疼可能的原因有以下几种：1、痔疮，尤其是血栓性外痔的情况，容易出现肛门里面疼痛的现象，合并感染时更为明显。2、直肠炎、急性胃肠炎及溃疡性结肠炎等炎性疾病造成的。3、肠道的肿瘤，比如直肠癌、肿瘤不断长大刺激、压迫周围神经，导致疼痛出现。如果发现肛门里面疼痛，建议到正规的专科医院完善相关的检查，明确具体的诊断后根据不同的病情采取对应的治疗方式。