双肾小囊肿的治疗办法，一般要根据是否有无并发症判断。因为肾囊肿是泌尿道感染的易感因素，如反复尿频、尿急、尿痛及血象增高，出现畏寒，发热等不适，建议积极的应用抗生素治疗。当小囊肿直径大于5cm以上时，可以行肾囊肿穿刺引流来临时缓解。如患者为先天性常染色体显性遗传病，且自己的父母或者是子女也患有疾病时，建议临床观察。大多数当囊肿体积增大时可以出现肾功能异常，如尿素氮、肌酐升高，甚至是到达尿毒症期，此期需要进行积极的保肾治疗。