丙酸氯倍他索搽剂外用后有可能会出现局部刺激感、烧灼感，症状不严重时可以不必停药。也有少数患者在外用药物后会出现红斑、丘疹、瘙痒症状。严重时可以停止用药。丙酸氯倍他索搽剂是强效糖皮质激素。长时间大剂量外用有可能会导致局部毛细血管扩张，色素沉着，痤疮，多毛以及继发真菌感染、细菌感染等不良反应。如果长时间大面积应用或者是采用封包治疗，还有可能会因为全身吸收而引发可逆性下丘脑-垂体-肾上腺轴的抑制症状，表现为库欣综合征、高血糖、骨质疏松等不良反应。