苦参的副作用主要是其性比较寒，对于人体的脾胃可以造成损伤，长时间应用苦参会导致胃炎，甚至消化道出现功能障碍、消化不良、腹泻等。另外，苦参的一部分根和种子都有毒，在应用过程中会出现中毒的现象，主要是神经性的毒性比较大，有流涎、呼吸困难、心律失常、步态不稳，严重的会出现惊厥，甚至呼吸衰竭抑制而出现临床死亡。所以在应用苦参的过程中一定要注意，一定要去其毒性存其功效，在医生的指导下才能够达到治疗疾病的目的。苦参本身作为一种经常用的中药，临床效果非常肯定，对祛湿，特别是去湿热，治疗腹泻、痢疾、肠炎等，效果都非常好，一定要合理的用药。