药物治疗分为以下三种：一、抗微生物治疗，针对高原微生物选择有效的药物进行局部点眼治疗，对于严重的角膜溃疡可在球结膜下注射抗生素的方法，对于细菌培养及药物敏感试验结果尚未知晓而病情较为严重的溃疡开始时可同时试用多种广谱抗生素。二、糖皮质激素，应用糖皮质激素治疗应严格掌握适应症，可用于过敏性角膜炎、角膜基质炎的治疗，细菌性角膜炎急性期，真菌性角膜炎禁用糖皮质。三、口服药物，对于重症角膜炎，可加用口服药物增加局部营养，促进溃疡愈合，常使用维生素c维、生素b2、鱼肝油等，除了药物治疗之外也可以通过热敷、冲洗，散瞳等进行治疗，使血管部扩张解除瘀滞，同时促进血流增强抵抗力和营养，使溃疡得到迅速的恢复。