生殖器官有炎症，要根据性别，以及炎症的部位，而采取相应的措施，对于男性来讲，生殖器官表浅的炎症，比如包皮龟头炎，通常采用外用药物进行治疗，真菌性包皮龟头炎可以采用咪康唑、克霉唑软膏外涂，细菌性包皮龟头炎可以使用莫匹罗星软膏、氟西地酸软膏来进行治疗。如果是尿道炎、前列腺炎、膀胱炎，以及睾丸附睾炎，可以采用抗生素治疗，轻者可以使用口服抗生素，比如左氧氟沙星、阿奇霉素、头孢地尼、磷霉素等，严重者可以采用静脉输液治疗，比如三代头孢、喹诺酮类药物、大环内酯类药物，以及氨基糖苷类药物，对于生殖器官炎症都有很好的控制作用。另外，对于女性来讲，外阴炎，以及阴道炎也可以采用外用的药物，使用栓剂或者清洗剂，对于盆腔炎、子宫炎、子宫内膜炎、输卵管炎和卵巢炎，也可以采用口服或者是静脉注射抗生素来进行抗炎治疗。