小腿肚肌肉酸痛的原因有以下几种：1、由于劳损引起乳酸堆积过多，一般由于长时间的运动或者劳动会使肌肉出现无氧运动，这种情况会导致乳酸堆积过多，在休息下来的时候会出现小腿肚肌肉酸痛的情况。2、小腿肚肌肉酸痛可能与严重的感冒以及某些中毒有关系，一般由于感冒会使病菌产生毒素而导致肌肉酸痛，中毒以后有的毒物也可以损伤肌肉和神经，会出血小腿肚酸痛的现象。3、小腿肚酸痛可能与受寒以及缺钙有关系，当受凉的时候由于血管痉挛导致供血不足而出现神经损伤，会出现小腿肚酸痛，缺钙以后往往引起肌肉异常兴奋，会出现肌纤维的损伤，而出现小腿肚酸痛。