扁桃体发炎选择药物治疗，根据病因和病情来明确，一般尤其是在慢性扁桃体炎急性发作或者是急性扁桃体炎出现有细菌感染时，可以选择敏感的抗生素，比如青霉素类、头孢菌素类、大环内酯类以及喹诺酮类等药物，能够将炎症控制，并且还可以选择联合糖皮质激素，使用雾化吸入的方式给药，能够减轻炎症反应。在炎症完全控制之后，缓解期可以选择使用具有清热解毒功效的中成药，防止其复发。