临床上肠炎分为急性肠炎和慢性肠炎。急性肠炎绝大多数考虑可能是进食了一些不洁饮食，被细菌污染的水或者是食物，也见于一些病毒性因素如轮状病毒或者是诺如病毒污染的食物所引起的肠道炎症反应。对感染性肠炎特别是细菌性的，一般选用抗生素进行抗感染治疗，病毒性的选用抗病毒的一些药物进行对症治疗。同时积极地选用一些止泻的药物如蒙脱石散或者是一些调节肠道功能的药物如曲美布汀进行积极的治疗。同时加用一些益生菌，进行调整肠道菌群。大部分急性感染性肠炎预后良好。慢性肠炎主要是指一些炎症性的肠病，以克罗恩病或者是溃疡性结肠炎为代表。临床上多半要选用一些抗炎药，如美沙拉嗪或者是免疫抑制剂，激素，生物制剂等进行治疗。