肛门如果有疼痛，肿胀，首先就是考虑有感染性的疾病存在，比如存在肛门周围间隙的脓肿，或者是存在直肠黏膜下脓肿的情况。脓肿的发生主要就是受到细菌的感染，在早期的时候，可以发生肛窦炎，肛窦炎如果没有得到及时的治疗，进一步向周围的间隙蔓延，进而就会出现肛门周围组织的坏死，液化，进而有脓液的形成，可以引起肛门的肿胀和疼痛。一般是通过肛门望诊，肛门指检，以及肛周核磁共振的检查，或者是直肠内的超声检查来明确诊断，如果肛周脓肿诊断明确以后，还是要建议早做手术的治疗。