包皮上有个小水疱，一定要确定是普通的包皮炎症，还是感染了疱疹病毒。如果是普通的炎症，建议将包皮清洗干净，保持干燥，局部涂抹碘伏，然后口服抗菌素，一般3-5天会缓解。如果小水疱是疱疹病毒感染，应该化验疱疹病毒。如果确诊是，则是疱疹病毒导致的水疱，应该口服抗病毒治疗的药物，最常见的是阿昔洛韦，这类抗病毒治疗需要两周左右。同时应该增强人体的免疫力，防止病毒进一步的扩散，而导致不容易愈合。