一侧扁桃体疼可能是急性扁桃体发炎、扁桃体肿瘤引起的。1、急性扁桃体发炎主要是免疫力和抵抗力下降，细菌以及病毒入侵的。扁桃体上隐口堵塞会导致扁桃体分泌物无法排出体外，就会导致一次肿大，并伴随疼痛的症状。2、扁桃体肿瘤主要是由于长期的饮酒、吸烟引起的，会导致促进粘膜上皮水肿、充血增生，以及鳞状上皮化生。在早期主要以喉咙疼痛为主，进食后以及喝水时疼痛会加重。