肛周脓肿属于肠道内细菌感染，肠道内细菌感染是其主要的致病因素。而肛窦是感染的入口，也是脓肿形成以后的内瘘。肛腺是感染的途径，而肛周间隙是最终的发病部位。当肠道内的细菌进入肛窦后，使其发炎，阻塞肛腺开口，导致肛腺液体流出受阻，引起肛腺感染。而感染又通过淋巴间隙，肌肉间隙蔓延至肛周间隙，最终形成肛管直肠周围脓肿，也就是所说的肛周脓肿。肛周脓肿种在临床上的主要症状是引起肛周剧烈的疼痛。而肛周脓肿，另外一个的症状就是发热，也就是红肿热痛等临床表现。