慢性肾衰是因为各种疾病长期慢性损害肾脏，最终导致肾组织被毁损，由于肾组织被毁损，正常的肾脏不能行使它的功能，导致水分和代谢废物不能排泄，出现电解质酸碱平衡紊乱。常见的病因包括慢性肾小球肾炎、肾病综合症、高血压肾病、糖尿病肾病、尿酸肾病、狼疮肾炎、乙型肝炎病毒相关性肾炎、肾动脉狭窄、慢性肾小管间质性肾病、遗传性疾病如：多囊肾等等。另外，如果一些急性肾脏疾病得不到及时治疗，或治疗效果不好，也可能成为慢性疾病，最终导致慢性肾功能不全，慢性肾功能衰竭甚至尿毒症。