黄连上清片在常规用法用量一般没有什么副作用，个别可能会出现胃肠道方面的症状引起烧心、反酸、纳差、恶心、呕吐、腹痛、腹泻，当然都比较罕见，个别会出现过敏反应，在用药后出现局部皮肤发红、瘙痒、皮疹，甚至类似荨麻疹样的改变。有一些人群比如有肝病、肾病。尤其是肝功能不全肾功能不全，比较严重的情况，服用黄连上清片需要格外的谨慎，有可能会加重肝功能不全，肾功能不全。另外如果是孕妇以及哺乳期女性，尽量不要用，一旦发生过敏需要立即停用。儿童必须在成人监护下应用，避免发生不良反应。