临床上能够引起咳出褐色痰的原因有很多，主要考虑是呼吸系统相关疾病引起的可能。可能的呼吸系统相关疾病包括:急慢性咽喉炎，急慢性支气管炎，肺炎，肺气肿，肺结核，支气管扩张，肺脓肿和肺恶性肿瘤等。想要明确病因，需要进行相关检查。包括胸部CT检查，电子喉镜检查，结核菌素实验，痰细菌培养和药敏试验，血常规，降钙素原，血沉，肺肿瘤标志物检查等。