直肠炎的主要治疗方式就是口服药物以及局部用药。口服药物包括常规治疗结肠炎的药，有氨基水杨酸类，如美沙拉嗪，肠道益生菌类，如斯联康，还可以吃一些中成药，包括清热利湿的健脾、助阳的药物，比如补脾益肠丸。合并有精神症状的，还可以使用抗抑郁药，比如黛立新。另外，直肠炎的治疗还可以使用灌肠和外用栓剂的方法进行治疗，一般来说，都可以使用中药灌肠，而栓剂主要选择的是美沙拉秦栓，因为这些药物，可以直接达到病灶所在的位置，效果也比较好。