甲硝唑主要是治疗肠道和肠外的阿米巴病，还可用于治疗阴道滴虫病，小袋虫病和皮肤利什曼病，再有就是麦地那龙线虫感染等等。目前还广泛用于厌氧菌感染的治疗。在服用的时候都会出现一些不良反应，以消化道反应最为常见，包括恶心、呕吐、食欲不振、腹部的绞痛。一般不会影响治疗。神经系统症状有的时候会出现头疼，眩晕，偶有感觉异常和肢体麻木，共济失调，多发性神经炎等等，大剂量的时候可能会导致抽搐。还有少数病例会发生荨麻疹、潮红、瘙痒、膀胱炎、排尿困难，口中金属味及白细胞减少等等，这些都是属于可逆性，停药以后就可以自行消失了。如果是有活动性中枢神经系统疾病的患者和血液病的患者禁止应用。这个药物它的代谢产物可以使尿呈深红色。而且这个药物它可以抑制酒精代谢，所以说在用药期间是绝对禁止饮酒的，饮酒以后可能会出现腹痛、呕吐、头疼这些症状的。