肠道阿米巴可随血流运动或偶以直接侵袭方式，到达肝、肺、脑、皮肤、宫颈、阴道等处，从而形成肠外阿米巴病。比较常见的并发症有以下几种：一、阿米巴肝脓肿，多继发于肠阿米巴病后1～3个月内，临床上患者常有发热伴右上腹痛、肝肿大及肝区压痛、叩击痛等症状和体征；少数病例出现黄疸、贫血、营养不良、腹水等表现。二、阿米巴肺脓肿较少见，有原发性和继发性之分，前者是血行播散所致，后者系阿米巴肝脓肿穿破横隔直接蔓延而来，占阿米巴肺脓肿的绝大多数。三、阿米巴脑脓肿，较少见，患者可有惊厥、狂躁、幻觉及脑瘤样压怕症状。如脓肿破入脑室或蛛网膜下腔，则出现高热、头痛、昏迷等症状，患者常于72小时内死亡。