肠道功能紊乱可使用以下药物治疗:1、对于腹痛的患者可给予解痉药，例如匹维溴铵，作为选择性作用于胃肠道平滑肌的钙通道阻滞剂，能够缓解腹痛且不良反应少。2、对于腹泻的患者可给予止泻的药物，轻症患者应给予吸附止泻药，例如蒙脱石散；对于腹泻症状较重者可给予洛哌丁胺或者地芬诺酯，但不宜长期使用。3、对于便秘型的患者，可酌情使用泻药，宜使用温和的轻泻剂以减少不良反应和药物依赖性，常用的药物有渗透性轻泻剂，例如聚乙二醇电解质散、乳果糖或容积性泻药，例如甲基纤维素等。4、对于腹痛严重，上述治疗无效患者，且精神症状明显者可给予抗抑郁的药物，最后应给予肠道微生态制剂，例如双歧杆菌、乳酸杆菌、乳酸菌等，可以纠正肠道菌群失调，对于腹泻、腹胀有一定的疗效。