兰索拉唑与其它的质子泵抑制剂类似，有一定的副作用。主要表现在消化道副作用，神经系统副作用，血液系统副作用，以及会出现过敏等等。在消化系统副作用中，主要表现为腹胀，上腹痛，恶心，呕吐，以及出现一过性的肝功能受损，表现为转氨酶和胆红素的轻度升高。神经系统副作用，主要表现为头晕，嗜睡以及头痛等等。内分泌系统的副作用，主要表现为维生素b12缺乏。血液系统副作用，主要表现为白细胞减少，以及血小板减少。皮肤过敏主要表现为皮肤瘙痒以及出现皮疹等等情况。