五维赖氨酸颗粒在服用期间引起的副作用是比较小的，可能会导致部分患者出现一些过敏反应，引起皮肤瘙痒或者皮肤有红疹、荨麻疹，通常停用药物并且给予抗过敏治疗之后这种症状可以很快缓解。另外五维赖氨酸颗粒在服用期间还会导致患者的尿色加深、尿色发黄，这是因为五维赖氨酸颗粒中含有B族维生素的成分，而B族维生素在人体内会被代谢成为核黄素，核黄素会随尿液排出体外，因此引起尿色加深、发黄。这种情况通常并不影响人体健康，在大量饮水之后尿色发黄的情况可以缓解，或者在停用五维赖氨酸颗粒之后这种症状也会自行缓解，通常是不需要特殊治疗的。