男性腋窝疼痛的原因主要有以下几点：第一，男性乳腺增生。发病原因主要就是由于药物因素引起了内分泌失调，使血液当中的雌激素水平不断增高，从而导致发生乳腺增生。第二，神经炎，疾病初期疼痛多位于一侧的锁骨上窝，或者是靠近肩部，疼痛以间歇性烧灼样疼痛为主。随着病情的加重和进展，疼痛会向同侧前臂以及手部扩张，活动上肢的时候腋下的疼痛会更加明显，第三，精神因素，如长时间精神紧张也会引起身体各部位的疼痛。第四，受凉，如果长时间受凉气的侵袭，也会造成腋下疼痛的症状。第五，皮脂腺囊肿合并感染，男性腋窝是皮脂腺囊肿的好发部位，由于男性腋窝汗腺分泌比较旺盛，所以容易发生感染形成脓肿。第六，集性毛囊炎，这是由细菌感染腋下毛囊而引起的炎症。患者可以出现腋窝疼痛，局部有肿大发红的情况。