糜烂性结肠炎引起的原因有很多，常见的与免疫紊乱、环境因素以及遗传等有关。一，免疫异常是造成炎症和损伤的内在因素，糜烂性结肠炎患者肠黏膜分泌异常，黏液糖蛋白改变，影响肠黏膜的完整性，容易激发一系列抗原特异性免疫反应与炎症变化。二，肠道菌群整体或其产物在糜烂性结肠炎发病中起到重要的作用。三，临床上发现，有的患者血缘亲属患有结肠炎，糜烂性结肠炎在种族之间差异显著，在我国发病率比较低，在欧美等国家发病率比较高，遗传因素可能是引起糜烂性结肠炎的一个原因。有时饮食辛辣刺激的食物，饮食过硬、过糙的食物，也容易导致糜烂性结肠炎。