龟头上起小水泡，可能是包皮过长导致的，或者是有生殖器疱疹。在日常生活中，如果清洁不到位，包皮污垢堆积与龟头的摩擦等因素，就会导致龟头起小水泡。这种水泡呈现非透明样的，而且疼痛感不是特别的明显。患者也可能存在性病的，患病后水泡多呈现为成组分布，且水泡透明，疼痛感是比较明显的，主要跟不洁性生活有关。需要去医院做诊断，如果是包皮过长可以手术治疗，如果是性病要尽快治疗。