肛门上有湿疹可以通过涂抹药膏和口服杀菌消炎药物治疗，治疗效果根据个体差异和湿疹严重程度决定，没有最有效的药物。涂抹激素类药膏可以使用糖皮质激素类药膏，如地塞米松膏药等，可以及时控制症状。一旦因为长期使用激素产生皮肤色素沉着或者激素依赖可以更换钙调磷酸酶抑制剂，如他克莫司软膏等，减少药物的不良反应。口服药品可以使用抗组胺类药缓解瘙痒症状，加上抗生素类药防止感染的发生，严重者可以服用糖皮质激素类快速控制疾病，再辅助维生素B营养神经。