君岐肠胃合剂不能够长期吃。所有的药物都有一定的副作用，都是不能够长期吃的。君岐肠胃合剂，具有益气健脾、消食和胃的作用，在临床上主要用于脾胃虚弱、体乏无力、胃肠功能紊乱，孩子胃肠功能不好，消化不良的时候，在吃君岐肠胃合剂的同时，可以给孩子吃点益生菌、妈咪爱或者金双歧，调理一下肠道正常菌群。同时还要从平时的饮食上进行调理，平时不要吃的太多，太杂，不要吃生冷、辛辣、油腻刺激性的食物。