十二指肠炎可以在医师指导下服用氢氧化铝、碳酸氢钠、雷尼替丁、兰索拉唑、米索前列醇、吗丁啉等药物进行治疗。其中氢氧化铝和碳酸氢钠的功能是中和胃酸，防止十二指肠发炎部分被胃酸进一步腐蚀而加重病情；雷尼替丁、兰索拉唑是抑制胃酸分泌药物；米索前列醇是肠粘膜修护剂；吗丁啉可以促进肠道蠕动从而促进肠黏膜的修复来治疗十二指肠炎。在临床上，十二指肠炎和十二指肠溃疡的症状表现几乎一样，难以通过外在症状判断两者的区别，所以在发生十二指肠炎症状的时候建议到医院确诊一下，以便能够正确的治疗疾病。