头孢长期吃最主要的危害有两点：一点是对肝肾功能的损伤，第二个是会产生耐药性。头孢是我们最长使用的抗生素之一，它主要作用于细菌的细胞壁。因为人体没有细胞壁的成分，因此头孢不会对人体的细胞产生损伤，所以头孢是相对安全的一类抗生素，常用于特殊人群。长期使用头孢会有相应的副作用，首先，头孢是经过肝肾功能代谢的，长期使用可能会影响肝肾功能损伤。其次，头孢是抗生素类药物，长期使用可能会引起耐药菌的产生，从而导致耐药性的出现，因此，头孢长期使用，最主要是肝肾功能和耐药性的问题。