抗核抗体谱主要是检查自身免疫性抗体的，一般发生结缔组织病，风湿病的时候需要查抗核抗体谱。比如抗DNA抗体一般在系统性红斑狼疮中出现，而且作为系统性红斑狼疮活动的指标；抗组蛋白抗体可以在多种结缔组织病中出现，对药物性狼疮的诊断和鉴别有很重要的意义。抗DNA组蛋白抗体可以见于活动性狼疮，特别是狼疮性肾炎，抗双链DNA抗体和抗sm抗体，对于系统性红斑狼疮就具有较高的特异性。还有很多抗体对于诊断类风湿类风湿性关节炎，还有雷诺现象，肺部疾病，还有关节炎，关节痛，血管炎和中枢神经系统受累都有关系。